Jan Proper werd geboren op 10 december 1853 in Heerde. Hij was een aangetrouwde neef van Zwier van Dijk, orgelmaker in Kampen, die trouwde met de zus van Jan's vader. In 1871 ging hij bij zijn oom in de leer. Samen met hem bouwde hij enkele orgels. Vanaf 1886 voerde hij ook zelfstandig opdrachten uit. Het eerste orgel werd in 1887 gebouwd voor de Gereformeerde Kerk in Zierikzee. Na de dood van Zwier van Dijk in oktober 1894 nam Proper dienst bedrijf over. Jan Proper was niet alleen als orgelmaker actief, maar ook als organist, vanaf 1894 van de Bovenkerk in Kampen, een functie die hij tot 1919 vervulde. Proper bouwde veel orgels, merendeels met één manuaal en aangehangen pedaal. Vaak verwerkte hij oudere orgels in zijn instrumenten, of plaatste hij tweedehands orgels. Na zijn dood te Kampen op 4 november 1922 werden de werkzaamheden voortgezet door zijn zoon Dirk J. Proper. Deze bouwde echter geen nieuwe orgels. Wel voltooide hij waarschijnlijk het laatste orgel dat door Proper werd geleverd, in de Noorderkerk te Kampen.
| Nieuwgebouwde orgels |
| Jaar | Plaats / Gebouw | Opus |
| 1885 | Genemuiden, Hervormde Kerk (gebouwd in samenwerking met Zwier van Dijk) | |
| 1887 | Zierikzee, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1960) | |
| 1888 | Mastenbroek, Hervormde Kerk (gebouwd in samenwerking met Zwier van Dijk) (afgebroken in 1965) | |
| 1888 | Vorchten, Hervormde Kerk | |
| 1890 | Heerenveen, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1921) | |
| 1890 | Rinsumageest, Gereformeerde Kerk (in 1913 afgebroken) | |
| ca. 1891 | Kampen, Gereformeerde Hagepoortkerk (afgebroken in 1900) | |
| 1891 | Krimpen aan den IJssel, Hervormde IJsseldijkkerk | |
| 1891 | Putten, Gereformeerde Kerk (verdwenen in 1905) | |
| 1891 | Zalk, Hervormde Kerk (gebouwd in samenwerking met Zwier van Dijk) | |
| 1892 | Andijk, Gereformeerde Kerk (in 1930 ingrijpend omgebouwd) | |
| 1892 | Enschede, Gebouw Elim (in 1952 naar Purmerland, Hervormde Kerk) | |
| 1892 | Mildam, Gereformeerde Kerk (in 1960 afgebroken) | |
| 1893 | Sneek, Gereformeerde Zuiderkerk | |
| 1893 | Wezep, Gereformeerde Kerk (afgebroken) | |
| 1894 | Katwijk aan den Rijn, Gereformeerde Kerk (afgebroken) | |
| 1894 | Sleeuwijk, Gereformeerde Kerk (zeer waarschijnlijk van Proper) | |
| 1894/1895 | Arum, Gereformeerde Kerk | |
| 1895 | Hengelo (Gld), Nederlands Hervormde Kerk | |
| 1895 | Hoogkerk, Gereformeerde Kerk (Vrijgemaakt) | |
| 1895 | Krabbendijke, Gereformeerde Kerk (1969: Glanerbrug, 1980: Hengelo (O), Kristalkerk) | |
| 1896 | Ermelo, Stichting Veldwijk (sinds 1923 in Vrouwenpolder, Gereformeerde Kerk (Vrijgemaakt)) | |
| 1897 | Coevorden, Hervormde Kerk (op kas na in 1972 afgebroken) | |
| 1897 | Culemborg, Gereformeerde Kerk (sinds 1927 op Schiermonnikoog, Hervormde Kerk) | |
| 1897 | Kampen, Doopsgezinde Kerk | |
| 1897 | Usselo (Enschede), Hervormde Kerk | |
| 1898 | Den Ham, Gereformeerde Kerk (sinds 1982 in Rijssen, Oud-Gereformeerde Kerk) | |
| 1898 | Doornspijk, Nederlands Hervormde Kerk (thans Hersteld Hervormde Kerk) (binnenwerk in 2005 vervangen) | |
| 1898 | Zwolle, Oosterkerk | |
| 1899 | Wapenveld, Hervormde Kerk (sinds 1951 in Middelaar, Parochiekerk) | |
| voor 1900 | Aalten, Oosterkerk (afgebroken in 1951) | |
| 1900 | Aalten, Westerkerk (afgebroken in 1951) | |
| 1900 | Kampen, Gereformeerde Hagepoortkerk (1930: naar de Westerkerk, 1977: afgebroken) | |
| ca. 1900 | Maasland, Gereformeerde Kerk (sinds 1950 in Gereformeerde Kerk (Maranathakerk) Utrecht) | |
| 1900 | Nijverdal, Vrij Evangelische Kerk (1949 naar Amersfoort, 1966 afgebroken) | |
| 1900 | Oud-Loosdrecht, Nederlands Gereformeerde Kerk | |
| 1900 | Stad aan het Haringvliet, Hervormde Kerk (binnenwerk in 1980 vervangen) | |
| ca. 1900 | Steenwijk, Zendingsgemeente "Bethel" (waarschijnlijk van Proper) | |
| 1902 | Almkerk, Gereformeerde Kerk | |
| 1902 | 's-Gravenmoer, Gereformeerde Kerk (afgebroken rond 1960) | |
| 1902 | Waarder, Gereformeerde Kerk | |
| 1902 | Winschoten, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1973) | |
| 1903 | Colijnsplaat, Hervormde Kerk | |
| 1903 | Hierden, Hervormde Kerk | |
| 1903 | IJhorst, Hervormde Kerk (binnenwerk in 1988 vervangen) | |
| 1903 | Leerdam, Nederlands Gereformeerde Kerk | |
| 1903 | Renkum, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1923) | |
| 1903/1904 | Schoonebeek, Gereformeerde Kerk (sinds 1950 in Woldendorp, Gereformeerde Kerk) | |
| 1904 | Baambrugge, Gereformeerde Kerk | |
| 1904? | Ermelo, Oude Kerk (sinds 1994 in Nieuwleusen, Hervormde Evangelisatie) | |
| 1904 | Heerde, Eben-Haëzerkerk (deels oud orgel) | |
| 1904 | Hoedekenskerke, Hervormde Kerk | |
| 1904 | Oudega (Wymbritseradeel), Gereformeerde Kerk (2001 naar Cluy in Roemenië) | |
| 1904 | Zuid-Beijerland, Gereformeerde Kerk (sinds 1963 in zonder orgelkas naar Andreaskerk Dordrecht, in 1982 gesloopt) | |
| 1904 | Zweeloo, Hervormde Kerk | |
| 1905 | Colmschate, Hervormde Kerk (afgebroken in 1938) | |
| 1905 | Dedemsvaart, Gereformeerde Kerk (afgebroken) | |
| 1906 | Bennekom, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1938) | |
| 1906 | Lutten, Gereformeerde Kerk | |
| 1906 | Rouveen, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1964) | |
| 1907 | Den Haag, Noorderkerk | |
| 1907 | Dwingeloo, Gereformeerde Kerk (afgebroken voor 1990) | |
| 1907 | Heemse, Gereformeerde Kerk (ca. 1950 naar Gereformeerde Kerk (Vrijgemaakt) te Eernewoude) | |
| 1907 | IJmuiden, Gereformeerde Wilhelminakerk (in 1942 gedemonteerd, kas verwoest in 1944) | |
| 1907? | Veendam, Doopsgezinde Kerk (afgebroken in 1976) | |
| 1907 | Zwolle,. Doopsgezinde Kerk | |
| 1908 | Aalsmeer, Gereformeerde Kerk (in 1957 naar Zuidhorn zonder de orgelkas) | |
| 1908 | Puttershoek, Gereformeerde Kerk (binnenwerk in 1975 vervangen) | |
| 1909 | Nieuw-Beijerland, Hervormde Kerk (sinds 1979 in Hei- en Boeikoop, Hervormde Kerk, binnenwerk gesloopt) | |
| ca. 1910 | Deventer, Hervormde Evangelisatie, thans Gereformeerde Kerk (Vrijgemaakt) (binnenwerk in 1973 gesloopt) | |
| 1910 | Diepenveen, Hervormde Kerk (afgebroken in 1968) | |
| 1910 | Hollandscheveld, Hervormde Kerk | |
| 1911 | Doornspijk, Gereformeerde Kerk (1967 naar Schipluiden, particulier, kas was al verdwenen) | |
| 1911 | Giethoorn, Doopsgezinde Kerk | |
| 1911 | Koekange, Hervormde Kerk (binnenwerk afgebroken in 1980) | |
| 1911 | Oosterend op Texel, Gereformeerde Kerk (verkocht aan particulier) | |
| 1911 | Wanneperveen, Hervormde Kerk (1971 binnenwerk vernieuwd) | |
| 1912 | Kampen, Gereformeerde Nieuwe Kerk (afgebroken in 1959) | |
| 1912 | Maarssen, Gereformeerde Kerk (al voor 1940 afgebroken) | |
| 1913 | Nijverdal, Hervormde Kerk (afgebroken) | |
| 1914 | Langerak, Nederlands Hervormde Kerk | |
| 1914 | Wijnjeterp, Hervormde Kerk (met ouder materiaal gebouwd) | |
| 1915 | Okkenbroek, Hervormde Kerk (omgebouwd oud orgel) | |
| 1915 | Sellingen, Hervormde Kerk (afgebroken in 1952) | |
| 1918 | Hasselt, Gereformeerde Kerk (Vrijgemaakt) (afgebroken in 1978) | |
| 1918 | Hoogersmilde, Gereformeerde Kerk (afgebroken in 1961) | |
| 1922 | Kampen, Noorderkerk (NH) | |
| Werkzaamheden aan bestaande orgels |
| Jaar | Plaats / Gebouw | Opus |
| 1884 | Berghuizen, Gereformeerde Kerk (plaatsing orgel uit Aardswoud) | |
| 1889 | Zwolle, Oosterkerk (plaatsing oud kabinetorgel) | |
| ca. 1891 | Oudega (Wymbritseradeel), Gereformeerde Kerk (plaatsing oud orgel) | |
| 1892 | Zwolle, Waalse Kerk (uitbreiding) | |
| 1894 | Hijlaard, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel) | |
| 1898 | Gasselternijveen, Gereformeerde Kerk (plaatsing ouder orgel, in 1939 afgebroken) | |
| 1898 | Kampen, Sint Nicolaas- of Bovenkerk | |
| ca. 1900 | Kampen, Broederkerk | |
| ca. 1900 | Kampen, Evangelisch Lutherse Kerk | |
| 1901 | Epe, Hervormde Kerk (uitbreiding) | |
| 1902 | Tilburg, Gereformeerde Kerk (plaatsing en ombouw oud kabinetorgel) | |
| 1902 | Waskemeer, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel, in 1916 verdwenen) | |
| 1903 | Berghuizen, Gereformeerde Kerk | |
| 1903 | Oud-Avereest, Hervormde Kerk (uitbreiding) | |
| 1906 | Epe, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel) | |
| 1909 | Breukelen, Gereformeerde Kerk (ombouw en overplaatsing naar nieuwe kerk) | |
| 1910 | Den Ham, Nederlands Hervormde Kerk | |
| 1910 | Diever, Gereformeerde Kerk (plaatsing oud orgel) | |
| 1911 | Jubbega, Hervormde Kerk (plaatsing ouder orgel) | |
| 1912 | Kampen, Evangelisch Lutherse Kerk (uitbreiding) | |
| 1914 | Epe, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel) | |
| 1914 | Hasselt, Nederlands Hervormde Kerk | |
| 1914 | Langerak, Hervormde Kerk (plaatsing oud orgel van Ludwig Schwartze) | |
| 1915 | Hardenberg, Gereformeerde Kerk | |
| 1917 | Duurswoude, Hervormde Kerk (plaatsing oud orgel Lutherse Kerk Zwolle) | |
| 1919 | Gerkesklooster, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel) | |
| 1919 | Sleen, Gereformeerde Kerk (plaatsing tweedehands orgel) | |
